在平行时空的1985年，效力政府的超级英雄“笑匠”爱德华·布莱克被人杀害。四处逃亡的“罗夏”的沃尔特·科瓦奇意识到有人正向曾经的超级英雄痛下杀手，而这背后隐藏着更大的阴谋……

讲述了忍者神龟与蝙蝠侠跨时空相遇，他们本都是默默守护正义的使者。然而在铲除罪恶的过程中蝙蝠侠和忍者神龟产生了误解，经过一系列打斗后，解除彼此的误解，共同作战，守护城市的和平以及人们的安全。